应用简介
Gene Runner 是一款专业实用的生物基因分析工具。它能够帮助实验室工作人员的基因进行数据模拟分析,让数据能够可视化提供我们查看,支持多种序列分析,您可以在一个界面上模拟不同组的序列,利用颜色以及图形的方式区别基因组的变化过程。
【功能特点】
Gene Runner软件允许你搜索序列或蛋白质相匹配的全部或部分的当前文件的多个在线数据库。另外,你可以搜索软件的starblast服务器,与NCBI的BLAST或文本服务器。执行任何应用网络搜索菜单Gene Runner软件在线搜索。
你可以开始一个Editseq项目空或空白文档,或者你可以从各种格式的文件,打开一个现有的序列。如果序列文件长于需要,可以通过坐标指定序列的子范围。
你也可以从一个数据库访问Internet或Intranet输入序列,如DNASTAR的starblast或NCBI的Entrez数据库。
Editseq显示DNA或蛋白质序列和相关的评论和特点三可调的窗格。进入一个新的序列,输入适当的Iub核苷酸或蛋白质编码。一旦你输入了一个序列,你可以选择将残基分成三胞胎,十列,或者你选择的另一组。检查精度的顺序使用Editseq的校对和语音验证功能。
Editseq的搜索功能让你找到位置,开放阅读框的瞬间。此外,还可以对序列的任何部分或部分进行反转、补充或查看统计信息。您也可以翻译DNA序列或反向翻译蛋白质序列使用定制,表达特定的遗传密码。
你可以写写序列的任何意见直接进入的Editseq窗口中间窗格。默认情况下,当打开序列时,将在下窗格中显示。您也可以创建自己的注释,带或不带翻译,并在一个共同的标题和描述下连接几个功能。
【软件特色】
基因的运动员是专业的应用旨在提供遗传学家和生物学家提供一个可靠的工具,可以帮助他们轻松地进行基因分析。
发现限制性位点
酶限制图方法位于更多方法菜单中,使您能够创建限制性映射。
在确定限制位点后,可以通过选择琼脂糖凝胶模拟命令来预测琼脂糖凝胶的限制性片段的电泳分离。在查看模拟凝胶时,您可以将光标移到任何片段上,以显示其范围、大小和限制切割每个末端的限制酶的头。
应用程序需要的格式文件所包含的遗传信息,然后可以使用“ORF分析”(开放阅读框)按钮,可以让用户设置优先核苷酸或氨基酸的大小,以及选择工作表的翻译。开放的ORF的项目后,用户可以对每个条目进行各种注释。
矩阵模式
这种方法,位于更多的方法部分,发现序列特征,如起始位点,剪接受体位点和剪接供体位点。矩阵模式是在单独的数据文件中定义,Gene Runner软件\矩阵式文件夹(MAC)。而由密码子预测方法确定的起始密码子是简单框架ATGs,矩阵模式方法考虑局部序列与预测功能的子集为ATGS起始密码子的目的。
允许你同步更新两个工作在相同的文件在任何或所有五lasergene应用在同一时间。这样的变化在一个应用程序将自动应用的两个相同的共享数据的其他应用程序。
开放和节省开允许你在任何序列文件的命名和保存应用以上文件的格式,这是usable市“任何的其他应用程序。
“限制性分析”功能的基因流道,用户只需检查的序列的一部分,通过进入优选的切位点。此外,他们可以分析所有的酶的类型或复发/非回文。此功能还提供了用户设置一个精确的分析区域和丢弃出挑的选项。