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Beacon Designer 8(设计引物软件) V8.14 免费版
  • Beacon Designer 8(设计引物软件) V8.14 免费版

  • 类别:理科工具系统: WinAll
  • 大小:56.35M时间:2020-08-04 10:03:39

应用简介

  Beacon Designer是一款功能强大的引物设计软件,能够帮助用户轻松建立核苷酸分析、NDA分析等项目,为用户的引物分析工作提供了帮助。因为软件为试用有时间时间限制,所以小编为大家找来了软件的破解版,安装完成即为正式版。

Beacon Designer

【软件特色】

  1、FRET探针

  FRET探针-设计出不含二聚体,重复序列和运行序列的最佳FRET探针,以确保信号保真度。

  多重FRET探针和引物-检查FRET探针是否与所有引物交叉杂交,以防止多重反应竞争。

  评估预先设计的FRET探针和引物-允许使用SYBR®green引物设计最佳的FRET探针。

  算法-使用高度精确的SantaLucia最近邻居计算Tm热力学值。

  图形视图-显示探针二级结构的图形视图。

  2、Scorpions®底漆设计

  Scorpions®Primer-设计最佳的标准引物,Scorpions®引物,Probe和Scorpions®,不含二聚体,重复序列和运行序列,可确保信号保真度。

  等位基因识别-设计Scorpions®来检测野生和突变等位基因。

  MultiplexScorpions®和引物-检查Scorpions®是否具有交叉同源性,所有引物可防止多重反应竞争。

  预先设计的Scorpions®引物-允许使用预先设计的探针/引物来设计最佳引物/探针和蝎子。

  Tm计算-高精度发夹Tm计算。

  图形视图-显示设计的Scorpions®Primer的图形视图。

  3、底漆设计

  设计引物-设计针对SYBR®Green / Beacon /TaqMan®/ FRET /Scorpions®/ HRMA应用优化的引物对。

  算法-使用高度精确的SantaLucia最近邻居热力学值计算引物Tm。

  引物等级-根据引物效率对引物进行排名。根据引物的热力学性质和二级结构筛选综合标准引物。

  自动引物多路复用-检查引物池中的同源性,以减少引物二聚体。

  预先设计的引物-允许将先前设计的引物用于信标,TaqMan®,FRET,HRMA和SYBR®Green分析。

  避免模板的二级结构-设计引物时自动避免模板中的二级结构。

  避免交叉同源性-通过自动避免使用BLAST发现的同源性来确保信号保真度。

  引物扩增子和探针BLAST搜索-BLAST搜索引物,扩增子和探针以验证设计的特异性。

  SNP扩增用于信标,TaqMan®,FRET和HRMA化学试剂的引物旨在扩增SNP。 SYBR®Green引物的设计应使区分等位基因的核苷酸位于其中一种引物的3'末端碱基处。可以将HRMA分析设计为扩增SNP和所有其他类型的突变,例如取代,缺失,插入等。

  一致的条件-运行中的所有引物均针对相同的PCR反应条件进行了优化。

  4、爆炸搜索

  选择性cDNA扩增-通过设计跨外显子/外显子和外显子-内含子边界的引物来避免gDNA污染。外显子区域通过解释GenBank标头注释来识别。也可以手动指定它们。

  BLAST搜索-BLAST搜索整个序列,设计引物和扩增子以显现特异性。

  BLAST数据库-使用独立的BLAST搜索本地自定义数据库,或直接连接到NCBI服务器以获取公共数据库。

  重复和低复杂度区域-优化BLAST搜索参数以在搜索NCBI可用的基因组数据库时检测重复和低复杂度区域。

  BLAST结果视图-提供在序列,引物对,扩增子和探针上搜索BLAST的结果视图。

  5、数据库和数据管理

  设计模式-Beacon和TaqMan®设计位于不同的模块中:允许在运行时进行模式切换。

  项目-创建多个项目。通过为每个实验创建单独的项目,可以轻松管理多个实验的数据。

  应用程序数据库-维护用于序列信息和搜索结果的本地数据库。

Beacon Designer

【破解说明】

  软件内置了破解补丁,安装完成将“patcher”文件中的所有文件复制到软件的安装目录下即可自动注册成为正式版。

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