应用简介
Discovery Studio2019是一款非常专业的分子建模软件。该冉家从最基本的界面和显示模块到一些蛋白质模拟模块,药物发现和设计模块等等,主要帮助我们来对不同的生命科学进行模拟研究。
【功能特点】
使用CHARMm c41b1进行分子力学(MM)计算
支持广泛的电源领域,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等。
完全支持CHARMM分区机制并支持自定义无效定义
使用天生的CHARMm溶剂模型(GB)快速准确地电离蛋白质和残余pKs。
饮用水的快速溶剂,具有适用于非常大分子系统的可选抗离子
根据国标执行任何溶剂明确或最小化溶剂基分子力学(MM)
基于溶剂进行明确的溶剂或分子动力学模拟
为蛋白质结构添加隐含膜,以便您可以基于场强制定模拟模型。
使用基于CHARMm的对接引擎CDOCKER来执行基于配体的配体结合和精炼对接。
【软件亮点】
DS Protein Health
蛋白质三维结构合理性评价工具。Protein Health模块运用Profiles 3D方法,通过将三维结构的结构环境与特定氨基酸残基的优先外界环境相比较,获得相关结构性质与氨基酸序列信息之间的关系。通过Protein Health模块的分析,用户可以方便快速地找到蛋白质结构中不合理的区域。
DS Protein Families
通过分析某一蛋白家族蛋白序列的保守模式以及在三维结构上的保守残基的位置,可以在分子水平上更好地了解到蛋白功能机制。Protein Families的简单易用的流程(protocols),也可一步步地引导用户进行分析,从蛋白家族的序列或者结构比对,到进化踪迹分析。而进化踪迹分析包括用分层聚类的方法来建立蛋白家族系统树图以及把这些得到的功能注释信息画到你的三维结构上去。进行序列比对时,允许根据需要对比对结果添加约束,提高活性部位关键残基的比对效果。
【破解说明】
把对应的破解补丁复制到安装根目录,重新打开软件即可。