应用简介
Visual Molecular Dynamics是款功能强大的化学绘图和分子运动分析工具。它可以为研究人员提供可视化的生物化学分子的运动模拟,提供优秀的作图能力,操作简单,方便快捷,非常好用。
【使用说明】
VMD 是 Visual Molecular Dynamics 的缩写,是一个分子可视化分析工具,适用于蛋白质、核酸、脂双层,RNA,DNA等的分子动力学轨迹分析和作图,同时也支持有机分子轨道和电子分布的作图。VMD可以用来查看一般的分子,读取标准的蛋白质数据库(PDB)文件,并显示所包含的结构。
【注意事项】
VMD 提供了各种渲染和着色分子的方法,包括:简单的点和线、CPK球体和圆柱体、licorice bonds、backbone tubes and ribbons、卡通绘画和其他。VMD可用于动画和分析的分子动力学(MD)模拟的轨迹,在特殊情况下,可以充当外部MD方案作为一个图形化的前端显示和远程计算机上进行模拟动画分子,它使用大型结构的高性能渲染的OpenGL和OpenGL可编程着色语言。