应用简介
GaussView5.0是款非常经典的分子结构绘图软件。用户可以通过这款软件快速设计出各种分子结构模式,非常适合用于学术研究和教学工作,让抽象的分子结构以形象的动画形式表现出来。软件界面简洁,操作简单,非常好用,不容错过。
【功能特色】
1. 搭建或者导入分子结构,用以创建输入文件;
2. 以图形化的方式自然直观的查看输出结果;
3. 绘制各种图谱;
4. 即时提交和监控计算(需要本机装有Gaussian软件)
【软件优势】
对于 Cartesian 搜索,每个重原子将在X, Y, Z方向上随机移动一个距离。此方法在寻找局域最小值(local minima)时较为有效。
对于Bonds方法,每个已选择的键将会随机旋转一个值,这会使分子构象产生较大变化。此方法在寻找局域最小值间的相互转化时较为有效。
对于环状化合物,在Bonds方法中提供了Ringmaker策略。它将打开环中的一根键,旋转其余键,然后再试图重新闭环。如果闭环之后的键长及键角不合理,那么此构象将不会采纳,程序将会进入下一个可能的搜索。此方法对于8元环(或更大环)这样易变形的分子较为有效。而对于不易变形的环状化合物,此方法则效果不佳。对于这种情况, Cartesian 搜索方法则较为有效。
一旦GMMX 搜索完成,所有的构象信息将会列出,你可以使用GaussView5以单个分子组形式打开和查看。同样,你可以查看这些构象的能量。
【软件亮点】
SC作业管理系统:SC作业管理系统是为局域网计算机而设置的队列系统(已载入GaussView 6中的服务器)。可以设置作业、加入一个队列及无需任何操作的情况下自动运行等。
在SC作业管理系统中有3个独立的队列,每个队列可以指定同时运行的作业数量。作业的状态可以通过SC作业管理系统中的Running Jobs及Finished Jobs 栏查看。SC作业管理系统也可以编辑作业类型(job types)、定义默认队列及其它高级设置。
对称性:GaussView中的点群对称性功能可以让你提高当前分子的对称性,可以限制一个分子为特定点群,之后的所有操作将会保持此对称性。
GaussView5允许降低当前分子的对称性。对于Jahn-Teller扭曲来说,保持某些分子的对称性对计算设置来说很有效,下图所示分子点群由D3h 变为D3。
刷选工具:GaussView5提供三种不同的工具来选择分子中的原子,最新的工具为刷选(brush selection)。此工具主要用于在紧密簇中快速选定原子。