SnapGene是一款非常专业的分子生物学分析软件。它的功能十分强大，为用户提供完善的计划，可视化和记录您的日常分子生物学程序的解决方案，节省了大量的时间和金钱，容易操作的可视化和模拟，该版本内置破解补丁，用户破解之后，可永久免费使用。

【功能特点】

　　成对对齐：可以通过局部，全局或半全局比对来分析成对的DNA或蛋白质序列。

　　从Ensembl导入：现在可以将来自Ensembl基因组浏览器的基因或转录数据直接导入SnapGene。

　　定向TOPO?克隆：一个新的界面可以模拟定向TOPO?克隆到拓扑异构酶激活的载体中。

　　灵活对齐参考：与参考DNA序列比对的界面已得到增强。各种显示选项的控件更加直观，并且可以将比对限制在参考序列的指定链或区域内。

　　可拖动的不对齐端：对于已与参考DNA序列部分比对的序列，现在可以将未比对的末端部分拖出并可视化。

　　AnzaTM酶：Thermo Fisher（Invitrogen）的AnzaTM酶系统已整合到SnapGene的酶数据库中。

　　DNA到蛋白质的比对转换：可以翻译DNA比对的选定区域以产生相应的蛋白质比对。

　　比对cDNA的内含子注释：当cDNA与参考基因组DNA序列比对时，该cDNA可用于创建一个特征，其中的缺口被注释为内含子。

【软件特色】

　　一、想象

　　1、DNA可视化

　　查看DNA序列的多个视图。

　　地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史

　　自定义酶位点，特征，引物，ORF，DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。

　　使用双链模式查看酶位点，具有翻译，引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览。

　　从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行，按名称或频率排序。

　　按名称，位置，大小，颜色，方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。

　　按名称，长度，颜色，结合位点，方向性或解链温度对杂交引物列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。

　　查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复

　　2、大序列支持

　　浏览染色体大小序列。

　　查看 · 搜索 · 缩放

　　利用SnapGene的高效数据处理功能，扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。

　　使用专有的MICA算法立即在染色体内找到序列。

　　使用多功能控件调整缩放系数和显示区域。

　　3、蛋白质可视化

　　查看蛋白质序列的多个视图。

　　地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史

　　自定义区域，站点，键和序列颜色的显示。

　　使用具有相关特征的1-或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列。

　　查看蛋白质的分子量，消光系数，等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析。

　　按名称，位置，大小，颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。

　　查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生。

　　4、直观的序列编辑

　　轻松编辑DNA和蛋白质序列。

　　标准编辑 · DNA结束

　　进行插入，删除，替换和大小写更改。复制并粘贴序列时，会自动传输功能。

　　编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。

　　5、序列颜色编码

　　将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。

　　给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。

　　6、特征注释

　　自动注释常用功能，或手动注释新功能。

　　自动特征检测 · 手动特征注释

　　使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。

　　选择DNA或蛋白质序列的一部分，并使用灵活的GenBank兼容控件注释特征。

　　二、模拟

　　1、限制性站点指标

　　确认限制性网站适合克隆。

　　独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质

　　以粗体显示独特的限制性位点，或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。

　　不要被愚弄，因为限制性位点被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点。

　　利用工具提示来避免有问题的限制网站。

　　2、限制性克隆

　　可视化克隆过程的所有方面。

　　如果您已经考虑过程，则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷，则可以捕获并纠正错误。

　　3、PCR

　　模拟标准PCR。

　　使用您自己的引物，或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。

　　4、重叠延伸PCR

　　通过重叠延伸PCR融合片段

　　最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向，SnapGene将设计引物。

　　5、引物定向诱变

　　使用诱变引物进行定点诱变。

　　选择诱变引物，按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。

　　6、网关？克隆

　　模拟网关？ BP克隆或LR克隆，或两者在同一时间。

　　为方便起见，提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段，SnapGene将设计引物。

　　7、吉布森大会？

　　通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。

　　选择要融合的片段及其方向，SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。

　　8、IN-FUSION ?克隆

　　通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法，可用于创建无缝基因融合。

　　选择要融合的片段及其方向，SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。

　　9、TA和GC克隆

　　通过TA或GC克隆捕获PCR产物。

　　选择传统的TA克隆或高效GC克隆。

　　为方便起见，提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。

　　10、退火Oligos

　　退火两个寡核苷酸形成双链产物。

　　使用简单的控件添加突出限制克隆。

　　三、避免错误

　　使用SnapGene，确保构造符合您的要求，并确认您获得了所需的序列。

　　1、阅读基因融合的框架

　　确保构造中的已转换要素符合框架。

　　链接翻译 · 警告信息

　　使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样，翻译链接在同一行。如果不是，则翻译在单独的行上。

　　2、与参考序列对齐

　　使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。

　　地图概述 · 序列详细信息

　　请参阅对齐序列与参考序列匹配的位置的概述，以及存在差异的位置。

　　四、自动录制

　　SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录，并将祖先结构存储在最终文件中。

　　1、全面的“撤销”能力

　　几乎撤消任何操作。

　　不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。

　　2、历史和嵌入式祖先

　　查看构造的图形历史记录。

　　单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分，或单击PCR引物名称以查看引物序列。

　　单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件，包括其注释和克隆历史记录。

　　3、历史色彩

　　使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。

　　详细了解构建体的组装方式，包括结扎的粘性末端。

　　五、拥有你的数据

　　SnapGene允许您根据需要阅读和共享文件，同时保持对数据的完全控制。

　　1、安全文件管理

　　将SnapGene文件保存在所需的位置。

　　使用熟悉的安全操作系统来存储和整理SnapGene文件。

　　2、从其他格式导入

　　阅读许多常见的文件格式。

　　不仅可以导入DNA序列，还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商，以确保您不会被锁定为专有文件格式。

　　3、导出为标准格式

　　将序列，地图或凝胶图像转换为标准格式，以便与其他软件一起使用。

　　将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。

　　4、使用SnapGene Viewer共享数据

　　将SnapGene格式的文件发送给可以下载免费SnapGene Viewer的同事或客户。

　　只需将文件与链接一起发送到SnapGene Viewer即可。收件人将能够看到地图，序列和注释，就像在完整的SnapGene界面中一样。

　　5、对于开发人员

　　要将SnapGene整合到您的数据分析或实验室管理软件中，请联系我们以获取有关如何读取和写入SnapGene文件的信息。

　　六、转换文件格式

　　开放式信息交换至关重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。

　　从其他格式导入时，目标不仅是捕获DNA序列，还捕获注释和注释

　　新功能介绍

　　1、重叠群大会

　　线性或环状重叠群可以从重叠序列或Sanger序列迹线重新组装。

　　2、灵活的对齐

　　现在可以以各种方式导入要对齐的序列。可以提取多个对齐的一部分以生成新的多重对齐，或者可以编辑现有的多个对齐以添加或移除由不同算法生成的对齐。

　　3、Nicking Enzymes

　　可以显示Nicking核酸内切酶。当选择跨越从线性序列的末端到切口核酸内切酶位点时，可以通过按Delete删除该单链区域。

　　4、点特征

　　现在，DNA序列支持零长度点功能，并在从GenBank，MacVector或Gene Construction Kit导入文件时识别。

　　5、酶网站突出显示

　　常用的酶位点可以用黄金突出显示，以便快速识别。

　　6、协调一致性增强

　　多重比对的共识序列具有改进的格式，现在可以复制或导出。

　　7、用于与参考序列对齐的存储编辑

　　根据流行的需求，当通过调整比对序列的端点编辑与参考DNA序列的比对时，保留和恢复那些编辑。

　　8、从其他文件格式导入功能

　　可以将特征导入到BED，GFF3或GTF格式的DNA序列中。

　　9、从UniProt导入

　　可以从UniProt数据库导入蛋白质序列记录。

　　10、进口基因组编译器项目

　　现在可以在SnapGene中直接打开Genome Compiler项目文件（。gcproj）。对于施工项目文件，在“历史记录”视图中捕获施工历史。

　　11、引物添加日期

　　将引物添加到文件时，会记录日期。引物可按添加日期排序。

　　12、读取和写入对齐文件格式

　　SnapGene可以将对齐导入SAM / BAM和VectorNTI?.cep格式的参考序列，并可以将对齐导出为SAM / BAM格式的参考序列。

【破解说明】

　　1、双击SnapGene.exe，安装软件

　　2、软件安装完成后，直接替换SnapGene.exe

　　默认路径C:\Program Files （x86）\SnapGene

　　3、安装破解完成，Enjoy

　　注册信息无需理会，实际是已破解